Аннотация: Разработан и реализован алгоритм выявления фракталоподобных структур в ДНК- последовательностях. Фрактальность трактуется как самоподобие, основанное на свойстве симметрии или комплементарной симметрии. Локальные фракталы интересны своей способностью аккумулировать множественные палиндромно-шпилечные структуры с потенциально возможными регуляторными функциями. Выявлены реальные случаи проявления фрактальности в различных геномах: от вирусов до человека. Рассмотрена возможность использования фракталоподобных структур в качестве маркеров, различающих близкие классы последовательностей.

Keywords: DNA sequences, fractal-like structures, repeated fragments, palindrome, complementary palindrome.

ACM Classification Keywords: J. Computer Applications – J.3 Life and medical sciences – Biology and genetics; I. Computing Methodologies- I.5 Pattern recognition – I.5.2. – Design methodology –Feature evaluation and selection.

Link:

ВЫЯВЛЕНИЕ ФРАКТАЛОПОДОБНЫХ СТРУКТУР В ДНК- ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ

Владимир Гусев, Любовь Мирошниченко, Надежда Чужанова

http://foibg.com/ibs_isc/ibs-08/ibs-08-p17.pdf